מערכת היחסים הביטחונית בין המדינות אינה חד-סטרית. במקביל לרכש המסיבי מישראל, ייצוא הנשק הסרבי לישראל זינק פי 42 מאז שנת 2023, והגיע אשתקד לשווי של 114 מיליון יורו. עובדה זו מעוררת פולמוס פוליטי בבלגרד, במיוחד לאור הקריאות מצד מומחי זכויות אדם של האו"ם לעצור את העברות הנשק לישראל על רקע המלחמה ברצועת עזה.
ההסכם החשאי מקיף מגוון רחב של נושאים, החל מחוזים משותפים ועד למכירת אמל"ח, ידע צבאי וטכנולוגיות דו-שימושיות. הגוף שאמון על יישומו בישראל הוא הממונה על הביטחון במערכת הביטחון (מלמ"ב), הפועל לעיתים גם לאיסוף מידע טכנולוגי זר. סעיפי ההסכם קובעים הקמת קבוצת עבודה משותפת, וחשוב מכך - הם מבטיחים כי סכסוכים עתידיים לא ייחשפו לציבור ולא יובאו בפני שום בית משפט או טריבונל בינלאומי או לאומי. "כל צד מתחייב להימנע מכל סוג של גילוי פומבי הרלוונטי לתחומי שיתוף הפעולה", נכתב במסמך, המדגיש את מעטה הסודיות הכבד המוטל על הציר הביטחוני המתהדק בין בלגרד לירושלים.