האלוף במילואים עמירם לוין טען בראיון לתקשורת שלשמעון פרס ז"ל לא היה שום חלק במבצע אנטבה, במהלכו כיהן כשר הביטחון. לוין אף כינה את פרס "שקרן" ו"נוכל". פרופסור מיכאל בר זוהר, הביוגרף הרשמי של שמעון פרס ז"ל, הגיב לדברים בראיון לניסים משעל ודרור רפאל ב"רדיו ללא הפסקה 103FM": "מאל"ף את ת"ו זה הכל שטויות. עמירם לוין לא מכיר את העובדות, לא ראה את המסמכים, אין לו מושג על מה הוא מדבר. חבל לי כי הוא היה מפקד טוב של סיירת מטכ"ל. יש לו היסטוריה טובה כחייל.
"הוא היה צריך להישאר שם. אין לזה שום שחר. כל דבר שאמרנו על שמעון פרס בנושא אנטבה, ממוסמך ומתועד. כל הדיונים של אותה מועצה, שמוטה גור (הרמטכ"ל דאז) לא הצטרף אליה וקרא לה 'מועצת הפנטזיה', שתכננה את המבצע, התקיימו יחד עם שמעון פרס. שמעון היה הכוח הדוחף. עד כדי כך שכאשר המבצע הסתיים בהצלחה כינס מוטה גור את כל אלופי צה"ל ואמר להם שיש אדם אחד (פרס) שדחף כלפי מעלה וכלפי מטה לבצע את המבצע ומגיע לו כל הקרדיט. וזה ממוסמך בלשכת הרמטכ"ל".
אבל פרס לא היה מעורב בדיון המקורי
"שמעון פרס לא היה מעורב בדיון המקורי, משום שרבין (ראש הממשלה דאז) פנה למוטה גור, לא לשמעון פרס, ושאל אם יש לו תוכנית", השיב פרופ' בר-זוהר. "להפתעת כולם מוטה אמר שיש לו. הוא הציע להצניח צנחנים באגם ויקטוריה שקרוב לאנטבה ואז הם יגיעו לאנטבה וישחררו את בני הערובה. רבין שאל אותו איך הם יחזרו ומוטה השיב שלזה עוד אין לו תשובה. אז רבין שלח אותו הביתה לעשות שיעורי בית, צחק על התוכנית ואמר שהיא מזכירה לו את 'מפרץ החזירים' של קנדי בקובה (הפלישה הכושלת של גולים קובנים לקובה בחסות ארצות הברית ב-1961)".
"ואז שמעון פרס הלך ביוזמתו למטה הכללי ויחד עם קבוצת קצינים, ביניהם דן שומרון (קצין חי"ר וצנחנים ראשי דאז), קותי אדם (ראש אג"ם דאז), בני פלד (מפקד חיל האוויר דאז) ושלמה גזית (ראש אמ"ן דאז). הם תכננו צעד אחר צעד את המבצע. אני דיברתי על כך עם מוטה, עם דן שומרון ועם שמעון כמובן, ויש לנו את הפרוטוקולים של הדיונים האלה. לפני כמה שנים מטכ"ל צה"ל, במחווה לשמעון פרס די להודות לו על הצלת בני הערובה, הביא לו את הפרוטוקולים האלה כשי. אז מה הוא מבלבל את המוח, עמירם לוין?! הוא פשוט לא היה שם".
משעל ציין שלוין היה באות הזמן בפריז ותחקר את האנשים ששוחררו כבר על ידי המחבלים. "נכון", אישר פרופ' בר-זוהר, "והוא עשה באמת עבודה יפה מאוד שם, כן". "מדוע המבצע הזה מעורר כאלה קרבות על הקרדיט?", שאל משעל. "אין פה קרבות", השיב בר-זוהר, "הכל כתוב והכל ברור. אין שום קרבות, הכל ממוסמך. אנחנו יודעים בדיוק איך הדבר תוכנן, בדיוק איך הדבר בוצע, מתי הממשלה החליטה, כל הדברים האלה ישנם. קרבות על הקרדיט בין האלופים? היה ויכוח בין משפחת נתניהו לדן שומרון ז"ל על חלקו של יוני נתניהו. זה ויכוח ביניהם, אבל זה לא שייך לסיפור".
רפאל שאל מה גרם ללוין להגיד לפתע את הדברים. "כל אחד רואה את הדברים מהזווית שלו", הציע פרופ' בר זוהר. "עמירם לוין היה רב-סרן, אז הוא ראה שביום אחד שהוא היה שם, הוא לא ראה את שמעון פרס. ומזה הוא כבר עשה סיפור ענק. קודם כל, שמעון פרס נפגש עם החיילים ביום החטיפה. הוא וקותי אדם נסעו לדבר עם מוקי בצר (מפקד כוח הפריצה במבצע אנטבה), כי אז חשבו שהמטוס ינחת בארץ. כשהתברר שלא, תכננו את המבצע. ואז פרס ראה את החיילים ואת יוני נתניהו ביום שבו הם המריאו לאנטבה משדה התעופה לוד ופגש אותם שם".