פרקליטות המדינה הגישה לבית המשפט השלום בראשון לציון כתב אישום, נגד חברת אירונאוטיקס ושלושה עובדים בכירים לשעבר בחברה, בגין עבירה על חוק הפיקוח על ייצוא ביטחוני, בקשר עם לקוח מהותי של החברה. החקירה התנהלה על ידי צוות חקירה ביאחב"ל שבלהב 433 ועל ידי חוקרי מלמ"ב במשרד הביטחון.
מרפאל נמסר בתגובה כי כתב האישום מתייחס לאירועים שהתרחשו על ידי נושאי משרה בחברה זמן רב לפני רכישת החברה על ידי רפאל, ואין לנושאי המשרה כיום כל מעורבות בפרשה.
כזכור, לפני ארבע שנים נחשף ב"מעריב" כי משרד הביטחון חוקר חשדות שלפיהם נציגים של החברה הישראלית אירונאוטיקס היו מעורבים בניסיון תקיפה של צבא של מדינה זרה על עמדה צבאית של מדינה אחרת, באמצעות מזל"ט מתוצרת החברה. החקירה החלה בעקבות תלונה שהוגשה למשרד הביטחון ושפרטיה הגיעו לידי "מעריב־השבוע". מאז אותו אירוע הרוחות בחברה סוערות וכבר התקיימו כמה דיונים בנושא בשדרת הניהול.
כמה חודשים לאחר מכן, המשטרה פתחה בחקירה נגד יצרנית המל"טים אירונאוטיקס בע"מ, סביב "עסקה מול לקוח מהותי".