על רקע העלייה בתחלואת הקורונה, גוברות ההערכות כי פתיחת שנת הלימודים עלולה להתעכב, או לפחות לא להתקיים כסדרה. גורם במשרד החינוך אמר ל"מעריב": "כבר די ברור שלא תהיה פתיחה מלאה ב־1 בספטמבר. השאלה היא כבר לא מה יקרה אז, אלא מה יקרה אחרי החגים והאם עד אז נהיה בסגר כלשהו. מבחינת המערכת יש היערכות לכל המצבים, אבל ברור שזה מצב לא אידיאלי, כי כשנדרשים להיערך ליותר מצבים אז קשה יותר להגיע למוכנות מלאה".
גם בקרב ההורים קיים חשש דומה. "אני די בטוחה שאנחנו הולכים לסגר. הסיכוי ששנת הלימודים באמת תיפתח כמתוכנן היא אפסית לדעתי, ואפילו בבית הספר של הילדים שלי כבר רמזו לנו על זה", מספרת אם ממרכז הארץ.
בימים הקרובים אמורים נציגי משרדי הבריאות והחינוך לגבש מתווה מתואם לפתיחת שנת הלימודים, כאשר אחת המחלוקות המרכזיות בין הצדדים היא האם לחסן תלמידים בשטח בית הספר או לא.
בזמן שבמשרד הבריאות מצדדים ביוזמה, שרת החינוך יפעת שאשא ביטון מתנגדת למהלך. למרות התנגדות השרה, מספר ערים הודיעו כי יאפשרו לחסן תלמידים בבית הספר, בהן תל אביב, בת ים, פתח תקווה ואשדוד.