מוזיאון ישראל הממוקם בירושלים הוריד אמש (שני) יצירות מופת ובעלות חשיבות למחסנים מוגנים. זאת, בשל ההיערכות למתקפה איראנית. לפי המוזיאון, המטרה בכך היא לנקוט משנה זהירות ולהגן עליהן מתוך מחויבות ואחריות לאוספי המוזיאון.
בין היצירות שמוחזקות במחסנים המוגנים: הפסל "נמרוד" של יצחק דנציגר, ציורים של פול גוגן ויצירות של ואן גוך. בתחילת המלחמה הוסרו המגילות הגנוזות ומאז לא הושבו בחזרה למקום.
עוד נמסר מהמוזיאון: ״באשר למגילות קומראן, נכס צאן ברזל יקר ערך, הן ירדו עם פרוץ המלחמה לחדר מוגן, פן יפגעו, ועם הורדתן, היכל הספר בו הן שוכנות נשאר סגור. בעקבות ביקוש גדול מהקהל לבקר מחדש בהיכל הספר, הוא נפתח מחדש לביקורי מבקרים, ומוצגות בו כעת העתקי מגילות״. למרות זאת, מוזיאון ישראל וכיוצא בזאת גם הגלריות פתוחות למבקרים בשעות הפתיחה.