החקירות של יהודה משי זהב: לאחר שהמשטרה פתחה בחקירה פלילית נגד מייסד זק"א, והחקירה בעיצומה, ראוי להזכיר כי כבר בשנת 2013, בתחקיר של העיתונאי קלמן ליבסקינד ל"מעריב", עלה לראשונה החשד לעבירות נוספות מצדו של זה.
בין השנים 2012-2014, סוקר לא פעם על פרשיית התרומות שנעלמו מהארגון. אף נטען כי משי זהב נתון היה לצרות כלכליות גדולות ובהן חובות בהוצאה לפועל ותשלומים לנושים.
תיבת הפנדורה באשר לכספי התרומות נפתחה לראשונה בתחקירו של ליבסקינד, שמספר כיצד עורך דין ששימש ממטעמו של בית המשפט המחוזי בירושלים כנאמן להסדר הנושים של עמות זק"א, חשף תרומות שלא הגיעו ליעדן. החקירה העלתה את החשד לכך שתרומות שיועדו לארגון לא הגיעו לייעדן, וחשף מעורבות של בני משפחתו בארגון יחד עם נסיעות לחו"ל שבוצעו על חשבון הארגון. כמו כן התגלעו כשלים בניהול ספרי החשבונות.
בתחקיר בשנת 2014, הוסיפו לבחון את סוגיית בתי המשפט שהתנהלה סביב יהודה, ואחיו משה ורמי, שהיו חשודים במעורבות בפרשה גם כן. עם זאת, על אף העיסוק בהיבט הכלכלי, החל להתבסס החשד בגין העבירות שיוחסו לו לאחרונה.