שלושה חודשים לאחר הפיגוע בחווארה: בפעילות משותפת של שב"כ וצה"ל הלילה (בין שבת לראשון) במחנה הפליטים בג'נין, נעצר על ידי לוחמי מילואים של חטיבת הצנחנים וכוח מג"ב, אסאמה בני פדל, שביצע את הפיגוע במכון השטיפה בחווארה בחודש אוגוסט האחרון, בו נרצחו שי ניגרקר ובנו אביעד. אסאמה נעצר בדירת מבוקשים במחנה הפליטים בג'נין כשהוא חמוש בנשק מסוג M-16. הוא הועבר להמשך חקירה בשב"כ.
כמו כן, במהלך הפעילות הלילית בג'נין חוסלו שישה מחבלים, עשרה נפצעו ו-15 נעצרו, כשבמקביל הוחרמו אמצעי לחימה רבים. כלים הנדסיים גם חשפו את האספלט במחנה הפליטים, בעקבות מטענים שהונחו על ידי מחבלים.
כזכור, שי סיילאס ניגרקר בן ה-60 ובנו אביעד ניר בן ה-29, נורו למוות בפיגוע הירי בחווארה. שני הנרצחים שהו בחווארה משעות הבוקר המוקדמות. הם עמדו ליד הרכב שהיה בשטיפה, ואז המחבל הגיע אליהם, ירה מטווח קצר מאוד ונמלט. בחמאס בירכו אז על הפיגוע, כשדובר הארגון, עבד אל-לטיף אל-קאנוא הצהיר כי "אנו מברכים על המבצע ההרואי בחווארה, שהוא תוצאה של פעילות נחושה ומתמשכת של ההתנגדות להגן על עמנו, להגיב לפשעי הכיבוש ולהגן על מסגד אל-אקצא".