ראש המוסד, יוסי כהן, נענה הערב (ראשון) בחיוב לבקשתו של ראש הממשלה, בנימין נתניהו, להאריך את כהונתו בכחצי שנה נוספת. במהלך יוני 2021 יוחלף ראש המוסד. על פי ההודעה הרשמית של לשכת ראש הממשלה, המהלך התבצע "בשל האתגרים הביטחוניים העומדים בפני מדינת ישראל".
כהן בן ה-58 נכנס לתפקידו כראש המוסד בינואר 2016, אז החליף את תמיר פרדו בראש הארגון. קודם לכן כיהן כראש המטה לביטחון לאומי. הוא הצטרף למוסד בשנת 1982 והתקדם בסולם הדרגות בארגון, עד שב-2011 מונה לסגן ראש המוסד.
כזכור, בשבוע שעבר מסרו גורמים בירושלים כי ראש המוסד יוסי כהן ביקר בירדן לאחרונה ונפגש עם המלך עבדאללה. הגורמים מסרו כי השניים דנו בנושא החלת הריבונות על בקעת הירדן.
לדברי הגורמים, אחד הנושאים שעלו בפגישה היו התנגדותה של ירדן לכוונת הממשלה להחיל ריבונות ישראלית בבקעת הירדן. כהן העביר מסרים מראש הממשלה בנימין נתניהו למלך הירדני, שמטרתם להפיג את היחסים המתוחים בין המדינות.